Oferta de lugar de trabajo

 RASTREO INFORMÁTICO Y PROSPECCIÓN DE BIOCATALIZADORES DE INTERÉS BIOTECNOLÓGICO ACTIVOS EN UNA MATRIZ DIVERSIFICADA DE CARBOHIDRATOS VEGETALES. 

Objetivo: 

• El objetivo general de este plan de trabajo es la búsqueda y análisis de enzimas activas sobre la biomasa vegetal, en particular glicósido hidrolasas, con potencial uso en un contexto de biorrefinería. Los productos esperados de la descomposición de distintas fuentes de biomasa (tanto de origen agroindustrial como marino) se utilizarían principalmente en la industria alimenticia y farmacéutica, como compuestos de naturaleza prebiótica. 

Objetivos específicos: 

• Utilización de distintas herramientas bioinformáticas para la prospección de enzimas; novedosas respecto a la actividad que catalicen, como a las posibles características operativas que posean (por ejemplo, termoestabilidad o tolerancia a altas concentraciones salinas). Para la búsqueda se utilizarán genomas obtenidos de los microorganismos del cepario del laboratorio de Bioconversiones de PROIMI, además de genomas, y metagenomas disponibles en las bases de datos públicas. Se analizarán con particular interés aquellos datos provenientes de ambientes de interés (marinos, altas temperaturas, altas salinidad), en búsqueda de biocatalizadores con propiedad previamente descriptas. 

• Análisis estructural y funcional de las putativas enzimas identificadas. Se realizarán modelados por homología y análisis de las secuencias codificantes de enzimas de interés, con el objetivo de predecir la estructura terciaria de las mismas y sus posibles actividades biológicas. 

• Estudios de Docking Molecular entre las estructuras obtenidas del análisis de las secuencias de las putativas enzimas identificadas y diversos sustratos de interés. Mediante estos análisis, se predecirá los posibles sitios de corte y productos generados por el accionar de las estructuras generadas. Además, estas herramientas permitirán evaluar los sustratos mas afines a lo posibles catalizadores identificados 

• Estrategias para la expresión heteróloga de putativas secuencias codificantes. Utilización de diversas herramientas bioinformáticas para las diversas etapas previas a los ensayos de clonado y expresión proteica: i) identificación de un posible péptido señal, ii) evaluación la probabilidad de expresion de forma soluble, iii) evaluación de la frecuencia del uso de codones raros en el huésped escogido, iv) diseños de cebadores, y clonado in silico del producto amplificado. 

Directora: Dra. M. Alejandra Martínez (ale.martinez.unt@gmail.com)

Codirector: Dr. Johan S. Hero (johanhero@hotmail.com)

Condiciones y requisitos: Estudiantes de la Licenciatura en Biotecnología en condiciones de realizar el trabajo final en PROIMI de manera virtual.